Docteur en égyptologie, Helène Bouillon est spécialiste des relations entre l’Égypte et le Proche-Orient de l'antiquité.
Elle dirige le service des expositions du musée du Louvre-Lens depuis décembre 2018 en tant que Conservatrice du patrimoine.
Elle est également membre de l'équipe « Mondes pharaoniques » à Sorbonne-Université et enseigne à l’École du Louvre.